Naukowcy Politechniki Śląskiej, wykorzystując chmurę Azure, analizują dane biomedyczne pacjentów z chorobami nowotworowymi, aby opracować dla nich spersonalizowane terapie.

Naukowcy z Wydziału Automatyki, Elektroniki i Informatyki oraz Centrum Biotechnologii Politechniki Śląskiej zajmują się analizą danych białkowych, pozyskanych m.in. od pacjentów z chorobami nowotworowymi. Jak tłumaczą, do poznania i zrozumienia biologicznej natury tych chorób potrzebne jest nie tylko badanie zmian genetycznych w komórkach rakowych, lecz również produktów ekspresji genów - czyli białek.

Praca śląskich badaczy jest ważnym elementem efektywnej diagnostyki medycznej, produkcji nowych leków i leczenia pacjentów. Często jednak sporym problemem, z którym borykają się naukowcy, jest brak odpowiedniej mocy obliczeniowej niezbędnej do analizy posiadanych danych. W tym właśnie wspiera ich Microsoft Research - które w ramach grantu bezpłatnie udostępnia uczonym zasoby chmury obliczeniowej Azure.

Projekt badawczy naukowców z Politechniki Śląskiej realizowany we współpracy z Microsoft Research jest doskonałym przykładem współpracy pomiędzy światem nauki a sektorem komercyjnym - uznał Microsoft.

 - Ze względu na to, że dane, które dostajemy do analizy, są bardzo dużych rozmiarów, potrzebna jest nam bardzo duża moc obliczeniowa - mówi kierownik projektu dr hab. inż. Dariusz Mrozek. - Czasami są to terabajty danych - co powoduje, że bardzo długi jest czas zastosowania określonej procedury obliczeniowej związanej z dowolnym typem analizy, który prowadzimy - a przez to wydłuża się również czas oczekiwania na wynik - wyjaśnia.

Tymczasem czas oczekiwania na wynik ma częstokroć kluczowe znaczenie.

- Wiąże się to często np. z wydłużeniem czasu zdiagnozowania poważnej choroby lub jej typu i w efekcie opóźnia to moment rozpoczęcia właściwego leczenia - tłumaczy dr hab. Mrozek. - Laboratoria i szpitale nie posiadają zwykle odpowiednich zasobów komputerowych, aby przetwarzać i analizować tego typu dane w szybkim tempie. Stanowi to poważne wyzwanie, które często staje się głównym wąskim gardłem w całym procesie odkrywania przyczyn powstawania poważnych chorób" - dodaje badacz. 

Śląscy naukowcy prowadzą również we współpracy z Centrum Onkologii w Gliwicach badania związane z profilowaniem molekularnym i znajdowaniem biomarkerów nowotworowych. Projekt badawczy realizowany jest przez naukowców z Wydziału Automatyki, Elektroniki i Informatyki oraz Centrum Biotechnologii Politechniki Śląskiej. Wspierany jest w ramach programu Microsoft Azure for Research. Firma Microsoft wyróżniła go jako przykład doskonałej współpracy pomiędzy światem nauki a sektorem komercyjnym.

Źródło: PAP - Nauka w Polsce